我國《食品添加劑使用衛生標準》（GB 2760-2014）規定：使用量按正常生產需要而定。檸檬酸鈉用于清涼飲料可緩和酸味，改進口味。在釀造中加入本品，可促進糖化作用，用量約為0.3%。在冰糕和冰淇淋制造中，檸檬酸鈉可用作乳化劑和穩定劑，用量為0.2%~0.3%。本品還可用作乳制品的防止酸敗劑，加工干酪和魚肉制品等的增黏劑，以及食品的甜味矯正劑

有學者探究了檸檬酸鈉對小鼠生理及的影響，結果表明，膳食中檸檬酸鈉的添加能降低試驗小鼠的體重，而高劑量的檸檬酸鈉可顯著提高小鼠血清中的含量。通過對小鼠糞便樣品的菌群分析，發現檸檬酸鈉的添加會影響其beta多樣性。在門水平上，與空白組相比，攝食檸檬酸鈉不會影響腸道微生物所屬門的種類，但會使厚壁菌門和擬桿菌門的比例發生變化，但是由于小鼠自身的個體差異很大，并且大部分的檸檬酸鈉可能在小腸部位被吸收，因此，結果未呈現一定規律性。而在屬水平上，除了共有的菌屬外，在當前的測序深度下檸檬酸鈉高劑量組還檢測到了Corynebacterium（和Staphylococcus（明攝食高劑量的檸檬酸鈉會對小鼠的腸道微生物造成一定影響，并可能通過菌群代謝產物的改變影響小鼠的血清生化指標