藥材干燥殺菌機可用于蜜丸、水丸、水蜜丸、濃縮丸、藥粉、顆粒等中藥固體制劑及原料藥和飲片的干燥滅菌，以及口服液、糖漿等瓶裝液體制劑的滅菌，原料藥等粉狀藥的干燥。 藥材微波干燥滅菌有如下的優點： ⑴微波對藥物加熱迅速而均勻、干燥速度快、時間短。由于是在濕物料內部加熱，熱傳遞方向與濕分傳遞方向一致，水分從物料中心向兩側擴散，路程比傳導加熱要少一倍，有利于提高物料干燥速率、縮短干燥時間。由于微波能直接為水分所吸收，物料內部和表面的水分能同時獲得微波而被加熱，所以加熱均勻、且干燥時間短，不影響被干燥物料的色香味及組織結構。例如將含水量從80%烘干降至20%時，用熱空氣干燥需20h，而用微波干燥僅需2h即可。又如用傳統烘房干燥400~500kg的丸藥，水丸需20h左右，蜜丸平均約需6h，而采用微波加熱干燥，水丸僅需4~5h，蜜丸約需1h。烘干時，原工藝至少需20d，而微波工藝只需7d。且有一定膨化作用，更利于人體吸收。 ⑵選擇性加熱，干燥溫度低，產品清潔，干燥及滅菌效果好、質量高。

在微波干燥中不同物質吸收微波的能力亦不相同，其中水分比其他一些固體物料具有更大的吸收能力，所以利用微波對含水物料的干燥特別有利，濕物料中水分獲得較多能量而迅速汽化，而固體物料因吸收微波能力小，溫度不會升的很高。而且在干燥的同時兼有滅菌殺蟲等效果，從而提高了產品質量。獲得的成品含水量均勻，清潔無菌，表面不結殼、皺皮或開裂等，干燥效果較理想。