微波對(duì)細(xì)菌的熱效應(yīng)是使蛋白質(zhì)變化，使細(xì)菌失去營養(yǎng)，繁殖和生存的條件而死亡。微波對(duì)細(xì)菌的生物效應(yīng)是微波電場(chǎng)改變細(xì)胞斷面的電位分布，影響細(xì)胞周圍電子和離子濃度，從而改變細(xì)胞的通透性能，細(xì)菌因此營養(yǎng)不良，不能正常新陳代謝，細(xì)胞結(jié)構(gòu)功能紊亂，生長發(fā)育受到而死亡。

常規(guī)熱力殺菌是通過熱傳導(dǎo)，對(duì)流或輻射等方式將熱量從食品表面?zhèn)髦羶?nèi)部，要達(dá)到殺菌溫度，往往需要較長時(shí)間。微波殺菌是微波能與食品及其細(xì)菌等微生物直接相互作用，熱效應(yīng)與非熱效應(yīng)共同作用，達(dá)到快速升溫殺菌目的，處理時(shí)間大大縮短，各種物料的殺菌作用一般在3-5分鐘。

常規(guī)熱力殺菌是從物料表面開始，然而通過熱傳導(dǎo)至內(nèi)部，存在內(nèi)外溫差。為了保持食品風(fēng)味，縮短處理時(shí)間。往往食品內(nèi)部沒有達(dá)到足夠溫度而影響殺菌效果。由于微波肯有穿透作用，對(duì)食品進(jìn)行整體處理時(shí)，表面和內(nèi)部同時(shí)受到作用，所以消毒殺菌均勻。