固相萃取主要通過目標物與吸附劑之間的以下作用力來保留/吸附的
1）疏水作用力：如C18、C8、Silica、苯基柱等
2）離子交換作用：SAX, SCX，COOH、NH2等
3）物理吸附：Florsil、 Alumina等
p H值對固相萃取的影響
pH值可以改變目標物/吸附劑的離子化或質子化程度。對于強陽/陰離子交換柱來講，因為吸附劑本身是離子化的狀態，目標物必須離子化才可以保證其被吸附劑吸附保留。而目標物的離子化程度則與pH值有關。如對于弱堿性化合物來講，其pH值必須小于其pKa值兩個單位才可以保證目標物離子化，而對于弱酸性化合物，其pH值必須大于其pKa值兩個單位才能保證其離子化。對于弱陰/陽離子交換柱來講，必須要保證吸附劑離子化才保證目標物的吸附，而溶液的pH值必須滿足一定的條件才能保證其離子化。
固相萃取的保留機制可分為兩種：
吸附劑（填料）保留目標化合物：絕大多數化合物應用此機制，填料保留其目標組分及少量雜質，通過淋洗步驟去除吸附在柱上的少量雜質，*后選擇合適的（洗脫）溶劑把目標組分洗脫下來。
根據吸附劑的保留機理可進一步分為：
（1）反相（C18,C8,CN,Phenyl,C4,C1）
·分析物：非極性至中等極性
· 基質：水溶性
· 方法：
a.活化：通常用水溶性有機溶劑如甲醇活化，然后用水平衡
b.淋洗：含0-50%極性溶劑的緩沖溶液淋洗雜質
c.洗脫：極性或非極性溶劑洗脫目標物
（2）正相（Silica, Florisil,Diol,NH2）
·分析物：中等極性到強極性
· 基質：非極性至中等極性
· 方法：
a.活化：非極性有機溶劑
b.洗脫：非極性有機溶劑
（3）陽離子交換（SCX,PRS,COOH）
·分析物：陽離子（堿性）化合物
· 方法：
a.活化：用于非極性有機溶劑中的樣品時，可用樣品溶劑來活化；在用于極性溶劑中的樣品時，可用水溶性有機溶劑過柱后，然后用水平衡，*后再用適當pH值的緩沖溶液進行平衡。
b.上樣：樣品溶液pH值要小于其pKa兩個單位（以保證其帶電荷）
c.洗脫：洗脫溶液pH值要大于其pKa兩個單位（中和分析物的電荷）
（4）陰離子交換（SAX,PSA,NH2，PAX/MAX ）
·分析物：陰離子（酸性）化合物
· 方法：
a.活化：用于非極性有機溶劑中的樣品時，可用樣品溶劑來活化；在用于極性溶劑中的樣品時，可用水溶性有機溶劑活化后，然后用水平衡，*后再用適當pH值的緩沖溶液進行平衡。
b.上樣：樣品溶液pH值要大于其pKa兩個單位（以保證其帶電荷）。
c.洗脫：洗脫溶液pH值要小于其pKa兩個單位（中和分析物的電荷）。
（5）吸附劑（填料）保留雜質
食品中色素等雜質的去除多用此機制。填料保留雜質而不保留或只保留極少量的目標組分，所以上樣后即開始收集目標組分，*后用目標物所在的溶劑進一步洗脫。合并兩部分收集液。
a.活化：以樣品所在的有機溶劑進化活化，1～2柱管體積
b.上樣：提取液轉移至柱內，并收集流出液
c.洗脫：用樣品所在的有機溶劑進一步洗脫，收集流出液。合并上樣和洗脫流出液。
