天然水的細菌性污染主要是由于糞便污水的排入而引起的。在健康人的糞便中一般只有腸道正常細菌，很少見到病原菌，而在腸道傳染病患者的糞便中有大量腸道病原菌存在。判斷水質是否安全可靠適于飲用，檢驗水中是否存在病原微生物。但由于致病菌在水中被稀釋，數量較少，容易被漏檢，而且技術較為復雜，所需時間長，即使檢測結果為陰性，在衛生上也不能保證安全。因此，一般不直接檢測水中的病原微生物，而是采用間接指標即糞便污染指示菌作為代表，檢測水體近期是否受到糞便污染。若在水中檢出糞便污染指示菌，則說明水體被糞便污染，亦即有被病原微生物污染的可能性，預示該水體衛生細菌學指標上不安全。

　　糞便污染的指示菌 — — 糞便污染指示菌的理想條件

　　可選作糞便污染指示菌的細菌需具有以下條件：

　?。?）、該指示菌僅在人的腸道生存并大量存在于人的糞便中，而且數量較病原菌為多;

　?。?）、該指示菌進入水體后不再自行繁殖;

　?。?）、該指示菌在水中存活時間應與病原菌基本一致或略長，對消毒劑等不良因素的抵抗力略強于病原菌;

　?。?）、檢出和鑒定方法簡單迅速，即使很少也能檢驗出來。