固相萃取裝置上樣方式：
  目前市場上有兩種提取正壓上部樣品和負壓樣品的方法，但負壓樣品不能有效地控制流量，導致儀器的不穩定性和重復性差。因此主流廠家普遍采用正壓采樣法，全自動固相萃取儀裝置采用高精度的噴油泵對樣品進行洗脫，對液體流量進行更精確的控制，從而大大提高了液體流量。儀器的重復性，確保樣品的回收。
固相萃取裝置對速度要求：
  單個樣品固相萃取裝置的周期通常為20分鐘左右，一般工廠的固相萃取儀幾乎相同。因此，一般來說，儀器同步的樣本越多，處理速度就越快。在6通道+ 3模式下，自動固相萃取方法靈活，提高了樣品處理速度。
如何有效避免堵塞：
  自動SPE的應用中經常遇到的問題是：流路堵塞導致儀器故障。當柱被堵塞時，大部分固相萃取儀器不能自動檢測樣品和溶劑泄漏，造成嚴重的損失和交叉污染。在全自動固相萃取儀的流程中，建立了一個高靈敏度的壓力傳感器。當流道壓力大于0.6 MPa時，系統將自動報警，從而有效地保護裝置。
能否對交叉污染控制：
  一些自動固相萃取裝置，樣品和溶劑使用相同的管道，很容易造成污染，特別是儀器沒有清洗功能。在短時間內，管道將保留多種化合物，這是實驗失敗的根本原因。全自動固相萃取儀采用流動分離裝置自動選擇溶劑，有機溶劑廢液具有獨立的廢液通道，有效避免交叉污染。