固相萃取裝置是從復雜基質中分離目標分析物的工具，各種色譜吸附劑的可用性使得能夠根據分析物和基質的特定化學成分進行有針對性的方法。SPE還能夠富集或預濃縮樣品中的分析物。將固相萃取裝置分析物濃度與用于測量它們的方法相匹配。鑒于這些的能力，固相萃取裝置被認為是分析樣品的設備。
使用真空歧管上的濾芯的SPE需要適當的培訓，必須注意實時保持適當的液體流量。每個技術人員每天可處理的樣品數量限制為30個。固相萃取裝置如果需要富集，則需要進行樣品干燥步驟，這會降低產量。
移液管吸頭，藥筒或96孔板的平行方法增加了樣品數量，平行液體流動在管與管之間或從井到井變化很大。平行流量的可變性增加導致分析物回收的額外變化，需要使用內部標準并接受較低質量，SPE吸附劑上的樣品/溶劑流動不是移液樣品/溶劑到每個孔。并行僅適度增加樣品通量，固相萃取儀但也由于更多數量的移液步驟而導致人為錯誤的概率。
為了提高固相萃取儀通量，可以將并聯方法與機器人結合進行移液，然而，在這個雙工作流程過程中，結果的質量較低。另一個缺點是機器人，從結果的角度來看，這似乎反映了速度，成本，質量，其中三者中的任何一個的收益都會從其他兩個中獲益。突破速度，成本，質量要對設備進行根本性改變，固相萃取裝置以便僅使用現有的分析儀器而不是高成本的機器人實現自動化和更高質量。
自動化固相萃取儀使用自動進樣器注射器進行濾芯調節，樣品上樣和廢物容器上的樣品清洗。注射器用于在干凈的小瓶或孔上進行洗脫，并且將用過的藥筒丟棄在不同的廢物容器中。注射器混合新洗脫的樣品后，完成用于測量樣品。實現精確的色譜分離，樣品預濃縮，固相萃取儀穩定的操作和自動化。
