從生化角度來看，細菌正常生長和繁殖的（RNA）和脫氧核糖（DNA）是由若干氫鍵緊密連接而成的卷曲大分子，微波導致氫鍵松弛、斷裂和重組，從而誘發遺傳基因或染色體畸變，甚至斷裂。微波殺菌正是利用電磁場效應和生物效應起到對微生物的殺滅作用。實踐證明采用微波裝置在殺菌溫度、殺菌時間、產品品質保持、產品保質期及節能方面都有明顯的優勢。

　　微波加熱技術應用范圍極廣闊，微波加熱技術在食品加工中應用僅是其中的一小部分。可以這樣說，人們在認識微波加熱特點的過程中，同時正在與現有技術相結合去開發出越來越多的新裝置和儀器。例如，微波爐和冰箱的組合冰箱；微波水壺和微波卷發器，微波加熱和洗衣機組合的微波烘干、洗衣機；微波熱水器，低溫水分測量儀等。微波加熱技術的發展與人們的認識和掌握，以及市場需求是密切相關的，其中*微波加熱設備和加工工藝尤為關鍵。

　　微波殺菌機用于粉狀、顆粒、片狀等食品、藥品、營養品、糧食制品、農副產品、牛肉、肉脯、方便面、速食品、米粉的干燥、殺菌，杏仁、花生、紅棗、桃仁、板栗的烘烤、膨化、殺菌、脫皮，醬菜、鹵味、各種肉制品小包裝的防霉、殺菌、保鮮，還用于科研院校的研究。