1、使用高溫水循環方式，將軟包裝食品加熱到121°C殺菌、滅菌的軟包裝滅菌器、側噴淋水式滅菌器、水浴式滅菌器等。
2、使用蒸汽與壓縮空氣混合循環氣體，，將軟包裝食品加熱到121°C殺菌的熱通風蒸汽滅菌器。
這幾種殺菌、滅菌方式的缺點
3、目前大量使用高溫水循環方式，將軟包裝食品加熱到121°C殺菌、滅菌，其缺點就是在121°C下食品的營養成分遭到很大的破壞與損失；同時在較高溫度下軟包裝食品的物質成分有較大的改變；同時還消耗大量的熱能。
4、使用蒸汽與壓縮空氣混合循環氣體，將軟包裝食品加熱到121°C殺菌的熱通風蒸汽滅菌器。其缺點是當循環不充分時，會出現殺菌滅菌死角，物品放置要求較嚴格；在121°C下食品的營養成分遭到很大的破壞與損失；在較高溫度下軟包裝食品的物質成分有較大的改變；最后就是消耗大量的熱能。
I、如使用微波對軟包裝食品進行直接殺菌，將能在短時間內起到殺菌效果。
微波殺菌是利用了電磁場的熱效應 微波殺菌是利用了電磁場的熱效應和生物效應共同作用的結果。微波對細菌的熱效應是使蛋白質變性，使細菌失去營養、繁殖和生存的條件而死亡。微波對細菌的生物效應是微波電場改變細胞膜斷面的通透性能，細菌因此營養不良，不能正常新陳代謝，細菌結構功能絮亂，生長發育受到抑制而死亡。此外，決定細菌正常生長和穩定遺傳繁殖的核酸（RNA）和脫氧核糖核酸（DNA），是由若干氫鍵松馳、斷裂和重組，從而誘發遺傳基因突變，或染色體 嘁畸變，甚至斷裂。
微波殺菌是通過特殊熱和非熱效應殺菌，與常規熱力殺菌比較，能在比較低的溫度和較短的時間獲得所需的消毒殺菌效果。實踐證明，一般殺菌溫度在75-80攝氏度就能達到效果，此外，微波處理食品能保留更多的營養成分和色、香、味、形等風味，且有膨化效果。如常規熱力處理的蔬菜保留的是46-50％，而微波處理是60-90％，常規加熱豬肝保持為58％，而微波加熱為84％。
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